A Educação Ambiental visa a construção de relações sociais, econômicas e culturais capazes de respeitar e incorporar as diferenças (minorias étnicas, populações tradicionais) e a liberdade para decidir caminhos alternativos de desenvolvimento sustentável respeitando os limites dos ecossistemas, substrato de nossa própria possibilidade de sobrevivência como espécie. O Programa de Educação Ambiental - PEA do IBF conta hoje com quadro de 3 biólogos formados com especialização na área ambiental além de uma Oceanóloga especializada na área de recursos marinhos e costeiros. Destacam-se as ações do subprojeto Franca Atuação, bem como Oficinas de capacitação e sensibilização para a educação ambiental, desenvolvidas junto aos professores da rede municipal e nas associações comunitárias com os moradores da região.